La Fundación Rei Afonso Henriques tiene fijados unos objetivos que buscamos alcanzar con nuestro trabajo y nuestro esfuerzo:
La fundación busca activamente potenciar la cooperación entre España y Portugal en materias como el desarrollo transfronterizo e institucional.
Canalizar iniciativas de promoción social, económica y cultural en la cuenca del Duero hispano-portuguesa es otro de nuestros objetivos primordiales.
Promovemos el estímulo de encuentros e intercambios entre personas e instituciones públicas y privadas en el ámbito docente, investigador, económico, y cultural en España y Portugal.
Buscamos colaborar con instituciones tanto públicas cómo privadas, portuguesas, españolas y a nivel de la Unión Europea para la promoción y gestión de programas que favorezcan la cooperación entre España y Portugal, la cuenca del Duero y las regiones transfronterizas.
La "Misión" de la Fundación corresponde a su razón de ser, a su primero y último propósito, a su esencia y motivación existencial. Por esto la "Misión" es relativamente estable e invariable. Reúne grandes fines y principios. La "Estrategia" de la Fundación es la consecuencia pragmática, modificable, revisable y adaptable a al "Misión" escogida entre varias estrategias establecidas.
Entre nuestros fines últimos destacan: