A Fundação Rei Afonso Henriques estabeleceu os objetivos que pretendemos alcançar com o nosso trabalho e esforço:
A fundação procura ativamente promover a cooperação entre Espanha e Portugal em questões como o desenvolvimento transfronteiriço e institucional.
Canalizar iniciativas de promoção social, económica e cultural na bacia hispano-portuguesa do Douro é outro dos nossos principais objetivos.
Procuramos fomentar encontros e intercâmbios entre pessoas e instituições públicas e privadas nas áreas da educação, investigação, economia e cultura em Espanha e Portugal.
Procuramos colaborar com instituições públicas e privadas, portuguesas, espanholas e ao nível da União Europeia para a promoção e também gestão de programas que favoreçam a cooperação entre Espanha e Portugal, a bacia do Douro e as regiões transfronteiriças.
A “Missão” da Fundação corresponde à sua razão de ser, à sua primeira e última finalidade, à sua essência e motivação existencial. É por isso que a "Missão" é relativamente estável e imutável. Reúne grandes objetivos e princípios. A “Estratégia” da Fundação é a consequência pragmática, modificável, revisável e adaptável à “Missão” escolhida entre várias estratégias estabelecidas.
Entre os nossos objetivos primordiais estão: